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        天津本生解答:DNA提取方法的總結

        更新時間:2022-11-17    點擊次數:2977

         

          天津本生解答:DNA提取方法的總結

         

          細菌DNA的提?。?/p>

          (一)

          試劑:

          1. 抽提緩沖液

          2% CTAB (W/V)

          2% PVP K25 (w/v) (去色素)

          100mM Tris-HCl (pH8.0)

          25mM EDTA (pH8.0)

          2.0M NaCl

          2.10M LiCl

          3. 2M LiCl

          4.DEPC-water(抑制RNA酶活性)

          5. 3M NaAc (pH5.2)

          6. 96% 乙醇

          7. 70% 乙醇

          細菌DNA的步驟:

          1.抽提緩沖液65℃預熱;

          2. 加菌體到已經預熱的緩沖液(700ul)中混勻,65℃,10min;

          3. 加酚/LV仿/ywc(25:24:1),振蕩,離心12,000rpm,10min;

          4.取上清,加LV/ywc(24:1)振蕩,離心12,000rpm,10min;

          5. 取上清,重復4步驟;

          6. 加入1/10體積的3M醋酸鈉和1.5倍體積的乙醇(或加入等體積的ybc),-20C沉淀;

          11. 離心12,000rpm,10min;

          12. 棄上清,70%乙醇洗,也可以再用100%乙醇洗,然后溶解于100ml 水中。

          (二)(我們常用的方法,但是有時有些細菌特別不好提,就用上面的方法)

          1. 將菌株接種于液體LB培養基,37℃震蕩培養過夜。

          2. 取1.5ml培養物12000rpm離心2min。

          3. 沉淀物加入567 ul的TE緩沖液,反復吹打使之重新懸浮,加入30ul 10%SDS和15ul的蛋白酶K,混勻,于37℃溫育1h.

          4. 加入100ul 5mol/L NaCl, 充分混勻,再加入80ul CTAB/NaCl溶液,混勻后再65℃溫育10min。

          5. 加入等體積的酚/LV/ywc混勻,離心4-5min, 將上清轉入一只新管中,加入0.6-0.8倍體積的ybc,輕輕混合直到DNA沉淀下來,沉淀可稍加離心。

          6. 沉淀用1ml的70%乙醇洗滌后,離心棄乙醇.

          真菌DNA的提取:

          (一)

          1.取真菌菌絲0.5g, 在液氮中迅速研磨成粉

          2.加入4mL提取液,快速振蕩混勻

          3.加入等體積的4mL的LV:ywc(24:1),渦旋3~5min(此處是粗提沒有加酚,可以節約成本的喲!)

          4.1000rpm,4℃,5min

          5.上清用體積的LV:ywc(24:1)再抽提一次(10,000 rpm,4℃離心5 min)

          6.取上清,加入2/3倍體積的-20℃預冷ybc或2.5倍體積的無水乙醇沉淀, 混勻, 靜置約30 min

          7.用毛細玻棒挑出絮狀沉淀, 用75%乙醇反復漂洗數次, 再用無水乙醇漂洗1次, 吹干,重懸于500 ?ulTE中

          8.加入1 ul RNaseA (10 mg/mL),37℃處理1 hr

          9.用酚(pH8.0):LV仿:ywc(25:24:1)和LV仿:ywc(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)

          10.取上清,1/10V 3M NaAc,2.5V體積的無水乙醇, -70℃沉淀30 min以上

          11.沉淀用75%乙醇漂洗,風干, 溶于200 ulTE中,-20 ℃保存備用

          DNA提取液:0.2M Tris-HCl(pH 7.5),0.5M NaCl,0.01M EDTA,1%SDS,

          3M NaAc

          細菌DNA的細菌(二)

          1.真菌菌絲0.5-1 g, 在液氮中迅速研磨成粉

          2.加入3 mL 65℃預熱的DNA提取緩沖液,快速振蕩混勻65℃水浴30 min, 期間混勻2-3次

          3.加入1 mL 5M KAc,冰浴20 min

          4.等體積的LV仿:ywc(24:1)抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)

          5.取上清,加入2/3倍體積的-20℃預冷ybc, 混勻, 靜置約30 min

          6.用毛細玻棒挑出絮狀沉淀, 用75%乙醇反復漂洗數次, 再用無水乙醇漂洗1次, 吹干,重懸于500 ?L TE中

          7.加入1 ul RNaseA (10 mg/mL),37℃處理1 hr

          8.用酚(pH8.0):LV仿:ywc(25:24:1)和LV仿:ywc(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)

          9.取上清,1/10V 3M NaAc,2.5V體積的無水乙醇, -70℃沉淀30 min以上

          10.沉淀用75%乙醇漂洗,風干, 溶于200 ul TE中,-20 ℃保存備用。

         

          注:僅供參考!

         

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